MoviePilot V1通过监测下载器中的下载任务状态来实现自动整理已下载的文件，通过设定 -> 连接 -> 下载器 打开 下载文件自动整理 开关开启自动整理功能。
5分钟。下载器种子标签，则只有下载器中有对应标签的下载任务才会被自动整理。对于非MoviePilot添加的下载任务，插件市场中提供了目录监控等插件实现自动监测和整理，这类插件通过监测文件变化来实现自动整理，注意参照 环境准备 中操作系统章节说明调整文件系统参数，同时需要打开下载器的为不完整文件添加扩展名选项，以避免文件在下载中就被自动转移了。
建议通过MoviePilot下载的内容优先使用内建的下载文件自动整理实现自动整理，基于监控目录整理等仅是插件提供的功能，非推荐整理方式。
MoviePilot V2版本支持按目录设定是否通过下载器监控整理或者目录监控整理，内建集成了目录监控功能，无需安装第三方插件。
5分钟，设定中所有启用的下载器且设定了对应目录时都会自动整理。如果使用
Qbittorrent做为下载器，可在 QB设置->下载完成时运行外部程序 处填入：curl "http://localhost:3000/api/v1/transfer/now?token=moviepilot" ，实现无需等待轮循下载完成后立即整理入库（地址、端口和token按实际调整，curl也可更换为wget）。
根据磁盘结构、空间大小、保种需要等综合决定使用哪种文件整理方式，在设定 -> 目录 -> 整理模式 中调整。
/moviepilot/.config/rclone）或在容器内使用rclone config完成rclone配置，网盘配置名称必须为：MP，可自行通过Docker添加环境变量传递参数优化传输，参考：https://rclone.org/docs/#environment-variables 。在 设定 -> 目录 -> 整理模式 中调整媒体库已存在同名文件（后缀名也相同）时对应的处理策略：
从不覆盖：当媒体库中存在同名文件时中断整理，历史记录中将产生错误的整理记录。按大小覆盖：当下载文件比媒体库中已有文件更大时覆盖已有文件，否则中断整理并在历史记录中将产生错误的整理记录。总是覆盖：直接使用下载的文件覆盖媒体库中的同名文件。仅保留最新版本：同一个电影或者电视剧剧集，删除媒体库中的其它版本文件（包括文件名不一致的），仅保留下载整理的最新版本。历史记录中手动进行整理。文件管理功能浏览文件系统，对整个目录或者某个文件进行手动整理。如涉及需要同时整理多个相似文件（比如一部剧有多集），参见 进阶 批量手动整理章节。